打扰各位，有些问题想要请教一下，
我公司从事眼镜零售，在外省市有分公司，我是总公司会计，所有公司账务都是我来处理，我们用的软件是SAP，总分公司为一个利润中心组，在一个公司代码下，每个分公司报表都是以他的利润中心来区分，现在有两个问题很困惑
一是关于发票的问题，现在的状况有：一张发票涉及到好几家分公司的费用，有些分公司和商场签约主体是总公司，租金物业等发票开给总公司，因为想要尽量保持每家公司损益的真实，我会按真实发生额分别记到每家公司，这样导致发票的抬头和费用承担的公司不一致，涉及到专用发票的，进项税也只能抵扣在其中一家公司，导致费用承担和进项税抵扣的公司不一致，请问这样操作，之后会有什么麻烦么？
二就是资金记账方面的问题，外省市分公司虽然都有开立账户，但是我在记账的时候收付款均没有分开利润中心记，只是统一记在了总部利润中心，平时各账户资金的实际收付只是出纳操作，我的会计账只能体现总分公司货币资金的总额，这样合理么？或是怎么处理会更好一些？
希望给为前辈给点拨一下，谢谢